La plongée à Malpelo est véritablement exceptionnelle de part la qualité et la quantité de sa faune. On y observe de très grands bancs de requins marteaux, de requins soyeux, de requins pointes blanches ou des requins Galapagos. On y croise de nombreux autres espèces comme des raies mantas et léopards, tortues, barracudas, carangues et serioles. Mais ce qui choque à la première plongée c’est le nombre incroyable de murène, parfois près d’une dizaine dans la même crevasse. Vous pourrez également y observer avec un peu de chance et si vous parvenez à descendre un peu le fameux requin féroce, un requin mi requin taureau mi requin blanc de 4 à 5 m de long. Malpelo est peut être l’un des meilleurs sites de plongée pour rencontrer du pélagique.